最终通缉犯被抓住，但是他们否认拿走了金币，而金币到底是被谁拿走了一直没有查出来，就此成了悬案。
另外三个小鬼倒是很大条，又是遭遇枪击，又是被麻醉弹放倒，居然一点都不怕，只是感叹没拿到金币，之前设想的美好未来却都成了泡影。但没伤心几分钟，他们又开始讨论最新的假面超人剧情。
江户川柯南默默叹了口气，这样说不定是件好事，起码比吓出心理阴影好。虽然这件事在他心里留下了深刻印象，但他也只能丢到一边，继续“惊喜”连连的日常生活。
这天毛利一家收到婚礼邀请，坐新干线去参加婚礼。江户川柯南内里是高中生，不会因为坐新干线而感到兴奋，老老实实坐在位置上吃便当，别提多省心了。毛利兰本来还担心带小孩出远门不好带，结果江户川柯南不像其他熊孩子一样。
结果毛利兰刚松了口气，江户川柯南就开始闹幺蛾子。
江户川柯南一直希望找到黑衣组织的线索，但即使跟着毛利小五郎查了很多案子，都没有抓到黑衣组织的尾巴。现在只是随便出趟门，居然直接撞上了琴酒和伏特加，当时他以为自己要被杀了，结果这两人都没认出他。
也是，他现在变成小孩子，正常人怎么回想到呢？而且琴酒和伏特加又没见过他小时候长什么样子。
此时的江户川柯南行事还比较莽，为了得到线索直接去跟琴酒和伏特加，结果被毛利兰揪回来，“不许乱跑！你给我乖乖待在这。”
江户川柯南很是无奈，但他现在的身份无法轻易让人按照他的话去做的，幸好他已经把窃听器放在了琴酒的位置上。见毛利兰和毛利小五郎聊天，他开始专心窃听。
伏特加吸了口烟：“终于能抽烟了。刚刚那个箱子里是什么东西，居然能卖出4亿。”
琴酒冷冷地掀起眼皮看了他一眼，伏特加立刻不敢说话了。琴酒看过漫画，知道会在新干线上遇到柯南，但他不能不做组织交给他的任务，所以还是按照原计划进行。他甚至没有改造手提箱里的炸弹，他只要修改炸弹的触发方式，就能把炸弹提前引爆，而不是像漫画里那样在最后一秒把炸弹踢出去。
但灭口只是他谨慎小心的做法，其实交易对象对组织什么都不了解，就像漫画中警察什么都没问出来。他如果提出要换掉已经做好的炸弹，是有点奇怪，而且也挺麻烦。
江户川柯南刚听了个开头就什么都听不见了，不由着急。
他们是来交易的，交易什么？和谁交易？
现在只有找到那个交易对象，才能有证据。但列车员是不会相信一个小孩说的话的，他不得不自己去找，结果才排除了几个人就被赶出了VIP车厢。他咬着牙，光从有手提箱和去过餐车这两点信息太少了。
新干线停下，琴酒和伏特加下车，江户川柯南不甘地看着他们离开，虽然很想追上去，但剩下的理智提醒他，他就算追上去成功的几率也很低。他再次进入VIP车厢，终于通过语言漏洞确认了交易对象。他没法直接要走手提箱，只能抢了就跑。
江户川柯南躲进厕所，门被拍的“乓乓”响。他想要先打开看看里面是什么东西，但突然有一种直觉让他停了下来，这种侦探直觉多次救了他。
江户川柯南把耳朵贴在手提箱上，并没有什么声音，“不会那么倒霉是炸弹吧？”虽然这样说，但他却因为刚才的不详感不敢打开手提箱。
就在这时厕所移门被毛利兰暴力拉开，“柯南！”江户川柯南浑身一抖，但在狭小的厕所里无处可躲，被毛利兰抓了出去，眼看就要被打，他立刻大喊一声：“手提箱里有炸弹！”
其实他也不知道手提箱里是什么东西，只是一着急就说出来了，这样可能就能迫使警察检查箱子里面。
由于江户川柯南之前的表现太像个熊孩子了，所以大部分人是不信他的，但保险起见，还是报了警，在下一站停车，已经有拆弹警察等着了。
江户川柯南发挥小孩的死缠烂打，硬是要留下看结果，主角光环发挥作用，警察居然真的让他留下来了。
警察小心翼翼地检查了手提箱，发现里面安装的炸弹能把一整节车厢炸上天，里面安装了手机作为引爆器，只要拨通就会爆炸。
到了这时，江户川柯南背上出了一层冷汗。他只是为了让警察调查手提箱内的东西，没想到自己乱说的成真了。简直险之又险，他们所有人就会死了。
手提箱的所有人立刻被警察审问，但她只知道是两个黑衣人卖给她关于金钱的情报，至于黑衣人是什么来历，她完全不清楚。于是线索就此断绝，成了无头公案。
江户川柯南利用毛利小五郎的声音给目暮警官打电话询问此事，知道之后虽然早有预料，但仍然非常失望。
另一边，琴酒把4亿日元交公，他发现自己有了漫画app，能够知道一小部分未来，但除了给组织赚了很多钱，好像也没什么用。至于为什么把钱全上交了……10亿元抢劫案和这次交易都是组织的任务，金币自己出手很麻烦，所以干脆交掉，他也不差钱。
最新的漫画本来是江户川柯南通过琴酒和伏特加的对话，知道了他们的代号，还知道手提箱里有炸弹。但现在这几话的内容变了，由于琴酒打断了伏特加说话，直到下车他们都没聊天，所以江户川柯南不知道代号和炸弹，只是从箱子交换了和伏特加说终于可以抽烟，推测出手提箱在哪里。
琴酒快速翻到评论区，发现读者好像没有发现漫画内容变更过。因此他推测，或许因为他的操作导致历史改变，漫画跟着改变，而他处在时间线的前段，所以当历史改变后，读者原来看过漫画的记忆就被覆盖了。
【这次好迷惑啊，为什么要做出这样的改变？】
【对啊，原来这章很精彩的，现在搞得逻辑感人，和后期的水平似的。】
【就是啊，本来柯南是从琴酒和伏特加的对话中知道炸弹的情报的，现在变成靠直觉，本来非常合理，现在变成柯学。之前明美没死，还能解释为后面还要出场，这里完全没道理。】
琴酒冷哼，当然没道理。他故意让江户川柯南失去了推理线索，正常情况下江户川柯南应该无法像漫画中一样在最后一秒把手提箱踢出去。但是在主角光环下，江户川柯南是不会死的，所以只能靠直觉和运气了。
这种特殊能力不用来探路也太浪费了吧？琴酒的左手支在沙发扶手上，撑着下巴思索。不过这小鬼的好奇心太重了，利用他的话，还要当心不会被他捣乱。
【按照进度，平次要出场了吧？双侦探搭档yyds！】
【我站快新！】
【就没人吃琴新吗？】
【哇！楼上什么**？新兰都世纪之吻了。】
【官配再甜也不妨碍嗑CP，我都可。】
【琴酒还是和赤井比较配，亲爱的恋人先生，七百码污人清白。】
琴酒忍不住露出地铁老人脸。他和赤井秀一？虽然赤井秀一逃跑后，BOSS把追杀的任务交给了他，但因为不知道赤井秀一在哪里，所以他也没有追得那么紧，毕竟他还有很多事做，不可能满世界找赤井秀一。准确来说他其实没见过赤井秀一，只看过照片，为什么会有人觉得他和一个素未谋面的人是一对？
再者，他也不可能和FBI拍拖。琴酒突然想起之前在评论里也看到，说他吃宫野明美的醋，这难道意味着他以后会背叛组织？琴酒实在想不出有什么理由会让他背叛组织，他不是个有良心的人，哪天被警察打死了，或者被寻仇杀死，他都不觉得奇怪，但是背叛……
肯定是这些读者瞎说八道！
琴酒转念又想，不管他之后怎么样，既然读者提到赤井秀一，说明之后这个卧底会回日本。
两年前赤井秀一凭借出色的表现快速往上爬，于是获得了和琴酒搭档的机会。但朗姆出于谨慎，提出要做最后一次测试，于是伪装成了老人进入仓库试探。赤井秀一不愧是王牌探员，完全不为所动。朗姆本来都要放弃了，结果一个憨憨跑出来。
琴酒接到朗姆的通知，就明白FBI想要趁机抓捕他。他为赤井秀一对他设伏这件事非常生气，没有组织的命令，他也想杀了赤井秀一泄愤。